生物信息學(xué)與生物計(jì)算：http://bioinformatics.weizmann.ac.il/

這是生物信息學(xué)和生物計(jì)算學(xué)的網(wǎng)站，由Weizmann科學(xué)研究所，生物服務(wù)部和Crown人類基因組學(xué)中心支持。研究領(lǐng)域主要涵蓋序列分析，蛋白質(zhì)組學(xué)和基因組學(xué)等。該網(wǎng)站提供了數(shù)據(jù)庫(kù)，電子論壇，教育，新聞，軟件，招聘啟事等。該網(wǎng)站還提供了相關(guān)鏈接，包括歐洲分子生物學(xué)以色列國(guó)家網(wǎng)點(diǎn)，以色列國(guó)家基因組基礎(chǔ)設(shè)施實(shí)驗(yàn)室以及國(guó)際生物信息學(xué)合作中心。

生物信息學(xué)專題：http://www.biosino.org/bioinformatics/bioinfo.htm

中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院生物信息中心的網(wǎng)站中的生物信息學(xué)專題提供與生物信息學(xué)有關(guān)的新聞信息，生物信息學(xué)文獻(xiàn)的介紹（包括的課題例如：鑒別腫瘤的亞型，細(xì)菌中的基因轉(zhuǎn)移，生物鐘與微陣列--哺乳動(dòng)物的基因組有節(jié)奏，混亂的DNA區(qū)分人類與黑猩猩等等），相關(guān)軟件下載，與數(shù)據(jù)庫(kù)的鏈接。

生物信息學(xué)專業(yè)網(wǎng)：http://bioinf.bmi.ac.cn/

生物信息學(xué)專業(yè)網(wǎng)旨在收集、整理與生物信息學(xué)相關(guān)的信息和資源。它的站點(diǎn)提供最近新聞；與生物科學(xué)相關(guān)的論文；與生物信息學(xué)相關(guān)的數(shù)據(jù)庫(kù)，軟件，公司，大學(xué)和期刊；工具的介紹，例如：序列逆向查詢系統(tǒng)。

生物信息學(xué)組織：http://bioinformatics.org/

生物信息學(xué)組織是生物信息學(xué)學(xué)科的綜合性網(wǎng)站。其涉及的內(nèi)容有新聞、事件提醒、會(huì)議消息、免費(fèi)FTP工具下載、論文、URL推薦、演示幻燈片等。此外，其還擁有有關(guān)生物信息學(xué)研究組和軟件的搜索引擎。

香港生物信息學(xué)中心：http://www.hkbic.bch.cuhk.edu.hk/

這是香港生物信息學(xué)中心(HKBIC)的網(wǎng)站。香港生物信息學(xué)中心是由香港技術(shù)創(chuàng)新委員會(huì)和香港中文大學(xué)創(chuàng)辦，為香港生物技術(shù)與工業(yè)界提供中心數(shù)據(jù)資源。它為使用者提供計(jì)算設(shè)備，技術(shù)專家意見和分子生物學(xué)定向數(shù)據(jù)庫(kù)等。主要致力于核苷酸、醫(yī)學(xué)、藥物設(shè)計(jì)、毒理學(xué)、生物技術(shù)、化學(xué)工程、制藥技術(shù)等方面的研究。該網(wǎng)站還提供了研究、工具、新聞等方面的。

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耶魯大學(xué)蓋斯坦生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)室：http://bioinfo.mbb.yale.edu/

這是耶魯大學(xué)蓋斯坦生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)室的網(wǎng)站。耶魯大學(xué)蓋斯坦生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)室主要致力于生物信息學(xué)的研究，其研究領(lǐng)域包括基因組序列，大分子結(jié)構(gòu)和表達(dá)基因數(shù)據(jù)，比較基因組學(xué)，基因表達(dá)分析，大分子幾何學(xué)等。該網(wǎng)站還提供研究、工作、演講、論文等方面的信息。

用于比較基因組學(xué)的生物信息學(xué)工具：http://pga.lbl.gov/Workshop/webTools.html

用于比較基因組學(xué)的生物信息學(xué)工具是勞倫斯伯克利國(guó)家實(shí)驗(yàn)室提供的用于比較基因組學(xué)的生物信息學(xué)的軟件、數(shù)據(jù)庫(kù)和網(wǎng)址資源。其涵蓋五個(gè)大類分別是：基因組數(shù)據(jù)、注釋、比較基因組、陣列資源、雜集。并且，對(duì)每個(gè)類別其都有類型、名稱和描述、幫助及信息等方面的說(shuō)明。

中國(guó)生物信息學(xué)資源導(dǎo)航：http://www.biosino.org/pages/source-bioinfo.htm

這是中國(guó)生物信息學(xué)資源導(dǎo)航的網(wǎng)站。該網(wǎng)站主要提供與生物信息學(xué)相關(guān)的學(xué)會(huì)、組織和生物計(jì)算中心的鏈接，也包含對(duì)網(wǎng)關(guān)及網(wǎng)絡(luò)資源的鏈接。

NCBI生物信息學(xué)研究工具：http://www.ncbi.nih.gov/Tools/

NCBI生物信息學(xué)研究工具網(wǎng)站由美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心支持。該網(wǎng)站提供了許多程序的鏈接，內(nèi)容包括數(shù)據(jù)挖掘、核酸和蛋白質(zhì)組分析等。同時(shí)，網(wǎng)站還提供了許多相關(guān)鏈接和資源。

歐洲生物信息學(xué)研究所：http://www.ebi.ac.uk/

歐洲生物信息學(xué)研究所是一個(gè)非盈利學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)，是歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的一部分。它是生物信息學(xué)研究和服務(wù)的中心。它所管理生物數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫(kù)包括核酸，蛋白質(zhì)序列和大分子結(jié)構(gòu)。它的使命是保證從分子生物學(xué)和基因組研究的日益增長(zhǎng)的信息向公眾公開，并且對(duì)科學(xué)研究團(tuán)體提供任何方面的免費(fèi)使用，以促進(jìn)科學(xué)發(fā)展。

歐洲生物信息學(xué)研究所Ensembl基因組瀏覽器：http://www.ebi.ac.uk/ensembl/index.html

歐洲生物信息學(xué)研究所Thornton研究組：http://www.ebi.ac.uk/Thornton/index.html

歐洲生物信息學(xué)研究所多序列聯(lián)配數(shù)據(jù)庫(kù): http://www.ebi.ac.uk/embl/Submission/alignment.html

歐洲生物信息學(xué)研究所工具箱:http://www.ebi.ac.uk/Tools/

歐洲生物信息學(xué)研究所核酸數(shù)據(jù)庫(kù):http://www.ebi.ac.uk/Databases/nucleotide.html

歐洲生物信息學(xué)研究所計(jì)算基因組研究組:http://www.ebi.ac.uk/research/CGG/index.html

歐洲生物信息學(xué)研究所完整基因組數(shù)據(jù)庫(kù):http://www.ebi.ac.uk/genomes/

歐洲生物信息學(xué)研究所序列數(shù)據(jù)庫(kù)研究組:http://www.ebi.ac.uk/seqdb/index.html

Brutlag生物信息學(xué)研究組：http://motif.stanford.edu/

Brutlag生物信息學(xué)研究組是斯坦福大學(xué)的一個(gè)研究團(tuán)體，主要研究從蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能，其開發(fā)了EMOTIF、EMATRIX和3MOTIF軟件應(yīng)用于非鑒定的基因組序列的功能確定，另外還開發(fā)了LOCK和3DSEARCH軟件用于比較蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)的搜索。

生物GBF信息學(xué)小組主頁(yè)：http://transfac.gbf.de/

生物信息學(xué)小組主頁(yè)是德國(guó)生物技術(shù)研究中心的生物信息組的主頁(yè)。其提供的資源十分豐富，包括出版物、研究計(jì)劃、研究組介紹、五個(gè)重要數(shù)據(jù)庫(kù)、十二個(gè)工具軟件和資源鏈接等。

Pune大學(xué)生物信息學(xué)中心：http://bioinfo.ernet.in/

Pune大學(xué)生物信息學(xué)中心成立于1987年，是生物技術(shù)系統(tǒng)的九大中心之一。提供生物工程領(lǐng)域的信息,側(cè)重病毒學(xué),蛋白質(zhì)和核酸序列與結(jié)構(gòu)。其提供的資源豐富，包括數(shù)據(jù)庫(kù)、微生物菌株數(shù)據(jù)網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)、生物信息學(xué)中心圖書館、Alpha服務(wù)器的軟件包、生物信息學(xué)的有用網(wǎng)址、EBI和PDB的數(shù)據(jù)庫(kù)鏡像等。

北京大學(xué)生物信息學(xué)中心：http://www.cbi.pku.edu.cn/

北京大學(xué)生物信息中心（CBI）成立于1997年，是歐洲分子生物學(xué)網(wǎng)絡(luò)組織EMBnet的中國(guó)國(guó)家接點(diǎn)。幾年來(lái)，已經(jīng)與多個(gè)國(guó)家的生物信息中心建立了合作關(guān)系。目前是國(guó)內(nèi)數(shù)據(jù)庫(kù)種類最多，數(shù)據(jù)量最大的生物信息站點(diǎn)。在基因預(yù)測(cè)、基因組、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)等領(lǐng)域都有相應(yīng)的研究項(xiàng)目。

加拿大生物信息學(xué)資源：http://cbr-rbc.nrc-cnrc.gc.ca/index_e.php

這是加拿大生物信息學(xué)資源(CBR)的網(wǎng)站。該網(wǎng)站由加拿大國(guó)家研究委員會(huì)(NRC)創(chuàng)建，旨在為國(guó)家研究委員會(huì)與其它政府、學(xué)術(shù)部門的科學(xué)家提供廣泛使用的生物信息學(xué)工具和共享數(shù)據(jù)。加拿大生物信息學(xué)資源部分由一個(gè)專門使用該資源的委員會(huì)管理，而且其資源在用于教育和非盈利研究時(shí)只需注冊(cè)均可免費(fèi)作用。網(wǎng)站還提供有關(guān)新聞、服務(wù)與下載等信息。

結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)公司：http://www.strubix.com/

結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)公司是世界上占領(lǐng)導(dǎo)地位的、蛋白質(zhì)組學(xué)推動(dòng)的藥物發(fā)現(xiàn)的公司，他們大規(guī)模地產(chǎn)生和使用蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)信息，以期加速發(fā)現(xiàn)和優(yōu)化過(guò)程。它提供的軟件主要針對(duì)加速藥物發(fā)現(xiàn)和優(yōu)化過(guò)程、提高篩選效率和降低成本、極大地重視知識(shí)產(chǎn)權(quán)的地位、提高藥物性能和增加技術(shù)和市場(chǎng)成功的可能性。此外，還提供三個(gè)藥物數(shù)據(jù)庫(kù)。

林奈斯生物信息學(xué)中心：http://www.lcb.uu.se/

這是林奈斯生物信息學(xué)中心(LCB)的網(wǎng)站。林奈斯生物信息學(xué)中心研究非?；钴S，隸屬于瑞典Uppsala生物醫(yī)學(xué)中心。作為一個(gè)由Uppsala大學(xué)與瑞典農(nóng)業(yè)大學(xué)的聯(lián)合研究機(jī)構(gòu)，確保了高質(zhì)量的尖端的研究與教育，其研究范圍從微生物與哺乳動(dòng)物基因組學(xué)經(jīng)計(jì)算機(jī)的功能基因組學(xué)到分子進(jìn)化。網(wǎng)站還提供有關(guān)入學(xué)、新聞時(shí)事、研討會(huì)、工具、學(xué)生計(jì)劃等方面的信息。

曼徹斯特大學(xué)生物信息學(xué)教育與研究：http://www.bioinf.man.ac.uk/

曼徹斯特大學(xué)生物信息學(xué)教育與研究是歐洲分子生物網(wǎng)絡(luò)的節(jié)點(diǎn)之一，負(fù)責(zé)維護(hù)一些數(shù)據(jù)庫(kù)（如蛋白質(zhì)模體指紋數(shù)據(jù)庫(kù)，PRINTS）。站點(diǎn)提供蛋白質(zhì)同源性分析，蛋白質(zhì)模體指紋分析，系統(tǒng)發(fā)生和序列進(jìn)化分析，以及微陣列分析，并提供生物信息學(xué)和PRINTS數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)下載。

《生物信息學(xué)》：http://www3.oup.co.uk/jnls/list/bioinformatics/etoc.html

生物信息學(xué)》是由英國(guó)牛津大學(xué)出版社出版。其主要刊登生物信息和計(jì)算生物學(xué)方面的研究論文、書評(píng)、綜述、讀者來(lái)信和述評(píng)等文章。其刊載的文章在兩年內(nèi)供給學(xué)術(shù)界免費(fèi)使用。

生物信息學(xué)：http://biotech.icmb.utexas.edu/pages/bioinfo.html

生物信息學(xué)是印第安納大學(xué)分子和細(xì)胞生物學(xué)研究所提供的生物信息學(xué)資源。此資源包括數(shù)據(jù)庫(kù)、基因發(fā)現(xiàn)程序、蛋白質(zhì)模建、生物信息學(xué)在線教程、研究基金的來(lái)源、研究項(xiàng)目和生物信息學(xué)工具軟件等。

生物信息學(xué)的網(wǎng)絡(luò)資源：http://www1.cs.columbia.edu/~cleslie/cs4761/resources.html

生物信息學(xué)的網(wǎng)絡(luò)資源是美國(guó)哥倫比亞大學(xué)的Bill Noble教授建立的有關(guān)生物信息學(xué)的網(wǎng)絡(luò)資源總集。其涉及面廣，包括基因組學(xué)和生物信息學(xué)中心、生物信息學(xué)工具和基因組計(jì)劃索引、DNA和蛋白質(zhì)分析工具、生物信息學(xué)課程主頁(yè)、生物信息學(xué)和生物技術(shù)的學(xué)術(shù)項(xiàng)目、生物信息學(xué)文獻(xiàn)參考，以及網(wǎng)上引物。

生物信息學(xué)趨勢(shì)導(dǎo)向：http://www.ped.med.utah.edu/genpedscrr/Trends.htm生物信息學(xué)趨勢(shì)導(dǎo)向主要提供《今天免疫學(xué)》雜志的增刊有關(guān)生物信息學(xué)的內(nèi)容。這些內(nèi)容包括的資源十分豐富，涉及文本格式數(shù)據(jù)庫(kù)，原理和實(shí)用數(shù)據(jù)庫(kù)搜索，計(jì)算生物學(xué)基因發(fā)現(xiàn)，多序列聯(lián)配和檢索，蛋白質(zhì)分類和功能歸屬，系統(tǒng)進(jìn)化分析和比較基因組學(xué)，功能基因組學(xué)等。

生物信息學(xué)網(wǎng)：http://starr2.myetang.com/

這是生物信息學(xué)的網(wǎng)站，主要是負(fù)責(zé)中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院腫瘤醫(yī)院/腫瘤研究所生物信息學(xué)研發(fā)及服務(wù)工作。該網(wǎng)站提供生物統(tǒng)計(jì)分析以SAS和R為主，并且設(shè)有其他數(shù)十種生物信息學(xué)分析輔助軟件，如Blast,Phrap, Bioperl, EMBOSS, Hmmer, GO等等。另外也提供論壇，相關(guān)論文以及常用生物信息學(xué)網(wǎng)址等。

生物信息學(xué)小組：http://life.anu.edu.au/

生物信息學(xué)小組成立于1997年，主要從事分子生物信息學(xué)和生物多樣性信息學(xué)的研究。其提供豐富的軟件資源，可免費(fèi)下載使用。軟件種類涉及重組掃描、系統(tǒng)發(fā)生分析、聯(lián)配、重復(fù)片段的檢測(cè)和PCR引物設(shè)計(jì)等。此外，還有許多數(shù)據(jù)庫(kù)資源。

常見的全文數(shù)據(jù)庫(kù)及其鏈接

Blackwell Synergy

http://www.blackwell-science.com/products/journals/jnltitle.htm;

Sciencedirect

http://www.sciencedirect.com/;

EBSCO

http://www.ebsco.com/home/default.asp;

OVID

http://www.ovid.com/;

Proquest

http://www.proquest.com/;

IDEAL

http://www.idealibrary.com/servlet/useragent?func=showHome;

OCLC

http://www.oclc.com/home/;

Interscience

http://www3.interscience.wiley.com/;

Springer

http://www.springer.de/;

LWW

http://www.lwwonline.com/;

Karger

http://www.karger.com/;

Kluwer Academic Publishers

http://www.wkap.nl/;

Oxford University Press

http://www.oup.co.uk/;

Annual Reviews

http://www.annualreviews.org/;

國(guó)內(nèi)外專利數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)址

列出網(wǎng)上一些很有價(jià)值的專利資源網(wǎng)址，供大家參考。

中國(guó)專利檢索

http://www.sipo.gov.cn/sipo/zljs/default.htm

中國(guó)專利全文數(shù)據(jù)庫(kù)（1985年-今）提供者：中國(guó)國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局

中國(guó)專利信息檢索網(wǎng) （http://www.jiansuo.com/）

可免費(fèi)檢索1985年以來(lái)的中國(guó)專利，部分可獲得專利說(shuō)明書全文。包括分類檢索與高級(jí)檢索兩種檢索方式。

分類檢索 給出國(guó)際專利分類表，可逐層顯示，點(diǎn)擊檢索，則鏈接到高級(jí)檢索界面。網(wǎng)址為：http://www.cpic.dhs.org/ipc/

中國(guó)專利信息網(wǎng)(http://www.patent.com.cn/)

該系統(tǒng)可以檢索中國(guó)專利，并提供文摘，還同時(shí)提供了與專利有關(guān)的多種信息，如專利轉(zhuǎn)讓、專利法規(guī)、專利代理機(jī)構(gòu)等。

中國(guó)專利文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)(http://home.exin.net/patent/)

該數(shù)據(jù)庫(kù)收錄了中國(guó)專利局自1985年以來(lái)公布的所有發(fā)明專利和實(shí)用新型專利，內(nèi)容有題錄、文摘、權(quán)利要求等。檢索途徑設(shè)有專利名稱、文摘、權(quán)利要求、申請(qǐng)人等共計(jì)27個(gè)字段。用戶可以根據(jù)需要選擇某一個(gè)字段，輸入關(guān)鍵詞進(jìn)行單項(xiàng)全文檢索；也可以選擇兩個(gè)以上字段進(jìn)行（AND）、或（OR）布爾檢索，但同一字段無(wú)法執(zhí)行布爾訪問(wèn)。

中國(guó)知識(shí)產(chǎn)權(quán)網(wǎng) (http://www.cnipr.com/)

中國(guó)專利檢索，技術(shù)產(chǎn)品及商標(biāo)的展示，圖書的網(wǎng)上展銷，知識(shí)產(chǎn)權(quán)信息服務(wù)。

中國(guó)發(fā)明專利信息網(wǎng) （http://www.1st.com.cn/）

該站點(diǎn)與《發(fā)明與革新》雜志社結(jié)成合作伙伴，提供專利檢索、專利快訊、好書及相關(guān)網(wǎng)站推薦、免費(fèi)點(diǎn)子庫(kù)、網(wǎng)上求助等服務(wù)。

臺(tái)灣專利數(shù)據(jù)庫(kù) (http://www.apipa.org.tw/)

由臺(tái)灣亞太智慧財(cái)產(chǎn)權(quán)基金會(huì)提供，使用臺(tái)灣BIG-5碼檢索和顯示。

國(guó)外專利檢索

http://www.uspto.gov/patft/;

美國(guó)專利全文數(shù)據(jù)庫(kù)（1790年-今）

提供者：United States patent and trademark office （美國(guó)專利商標(biāo)局）

http://ep.espacenet.com/;

世界知識(shí)產(chǎn)權(quán)組織專利數(shù)據(jù)庫(kù)（PCT）、歐洲專利數(shù)據(jù)庫(kù)、日本專利

提供者：The European Patent Office （歐洲專利局）

http://patents1.ic.gc.ca/intro-e.html;

加拿大專利全文數(shù)據(jù)庫(kù)（1920年-今）

提供者：The Canadian Intellectual Property Office （加拿大知識(shí)產(chǎn)權(quán)局）

Delphion Patent Server (http://www.delphion.com/)

注冊(cè)用戶通過(guò)Delphion 專利服務(wù)器可檢索世界各國(guó)專利，但非注冊(cè)用戶可以檢索到1974年以來(lái)的美國(guó)專利的文摘和全文的第一頁(yè)掃描圖像。

Delphion

世界各國(guó)專利，可看到前十三頁(yè)全文

Europe's Network of Patent Databases (歐洲專利)（http://gb.espacenet.com/）

該站點(diǎn)可以檢索到歐洲專利的文摘和全文的掃描圖像。并可檢索到世界知識(shí)產(chǎn)權(quán)組織(WIPO)的文摘和全文的第一頁(yè)掃描圖像。

歐洲及歐洲各國(guó)專利 (http://www.european-patent-office.org/espacenet/info/access.htm)

該網(wǎng)站由歐洲專利局提供，可用于檢索歐洲及歐洲各國(guó)的專利，包括歐洲專利（EP）、英國(guó)專利、德國(guó)專利、法國(guó)專利、澳地利專利、比利時(shí)專利、意大利專利、芬蘭、丹麥、西班牙、瑞典、瑞士等15個(gè)歐洲國(guó)家的專利。

PCT國(guó)際專利 （http://pctgazette.wipo.int/）

由世界知識(shí)產(chǎn)權(quán)組織（WIPO）提供，收錄了1997年1月1日至今的PCT國(guó)際專利，僅提供專利扉頁(yè) 題錄，文摘和圖形。

世界知識(shí)產(chǎn)權(quán)組織的IPDL （http://ipdl.wipo.int/）

由世界知識(shí)產(chǎn)權(quán)組織建立的知識(shí)產(chǎn)權(quán)電子圖書館，提供世界各國(guó)專利數(shù)據(jù)庫(kù)檢索服務(wù)，其中包括： PCT國(guó)際專利數(shù)據(jù)庫(kù)，中國(guó)專利英文數(shù)據(jù)庫(kù)，印度專利數(shù)據(jù)庫(kù)，美國(guó)專利數(shù)據(jù)庫(kù)，加拿大專利數(shù)據(jù)庫(kù)，歐洲專利數(shù)據(jù)庫(kù)，法國(guó)專利數(shù)據(jù)庫(kù)，JOPAL科技期刊數(shù)據(jù)庫(kù)，DOPALES專利數(shù)據(jù)庫(kù)，MADRID設(shè)計(jì)數(shù)據(jù)庫(kù)等。

Canadian Patent Database（http://patents1.ic.gc.ca/intro-e.html）

可以檢索1989年以后的加拿大專利，無(wú)文摘。

一．?dāng)?shù)據(jù)庫(kù)目錄

2000年，出版《核酸研究》的牛津大學(xué)出版社設(shè)立了一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)目錄網(wǎng)頁(yè)，這個(gè)網(wǎng)頁(yè)把數(shù)據(jù)庫(kù)分成18類在郝柏林、張淑譽(yù)編著的《生物信息學(xué)手冊(cè)》中，他們進(jìn)行了合并，又把數(shù)據(jù)庫(kù)目錄、農(nóng)林牧有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)、醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)和文獻(xiàn)單獨(dú)列出，分成以下16類：

1. 數(shù)據(jù)庫(kù)目錄

2. 綜合數(shù)據(jù)庫(kù)包括DNA序列陣：EMBL、GenBank、DDBJ、GSDB、TDB和UniGene

3. DNA序列數(shù)據(jù)庫(kù)主要是與基因結(jié)構(gòu)和認(rèn)定有關(guān)的數(shù)據(jù)庫(kù)，如密碼子使用頻度表、真核生物啟動(dòng)子庫(kù)、內(nèi)含子和外顯子庫(kù)等

4. RNA序列和核糖體數(shù)據(jù)庫(kù)

5. 基因圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)

6. 人類基因組數(shù)據(jù)庫(kù)

7. 其他物種基因組數(shù)據(jù)庫(kù)

8. 基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)

9. 基因突變、病理和免疫數(shù)據(jù)庫(kù)

10. 蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)

11. 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)

12. 比較基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)

13. 代謝途徑和細(xì)胞調(diào)控?cái)?shù)據(jù)庫(kù)

14. 與農(nóng)林牧有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)

15. 醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)

16. 其他數(shù)據(jù)庫(kù)

二．綜合數(shù)據(jù)庫(kù)

INSD,國(guó)際核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)（International Nucleotide Sequence Databank）由日本的DDBJ、歐洲的EMBL和美國(guó)的GenBank三家各自建立和共同維護(hù)

EMBL庫(kù)，歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的DNA和RNA 序列庫(kù)

http://www.ebi.ac.uk/embl.html

GenBank ，美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心 （NCBI）所維護(hù)的供公眾自由讀取的、帶注釋的DNA序列的總數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Web/Genbank/

DNA Databank of Japan (DDBJ) ，日本核酸數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.ddbj.nig.ac.jp/

GSDB是由美國(guó)國(guó)家基因組資源中心（NCGR）維護(hù)的DNA序列關(guān)系數(shù)據(jù)庫(kù)（Genome Sequence DataBase）

http://www.ncgr.org/gsdb/

TIGR DATAbase,是世界上最大的cDNA數(shù)據(jù)庫(kù)，還有大量的EST序列和人類基因索引（HGI）

http://www.tigr.org/tdb/hcd/overview.html

三．DNA序列和結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)

包括與DNA的復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、修復(fù)等有密切關(guān)系的蛋白質(zhì)因子

BioSino是中國(guó)自主開發(fā)的核酸序列公共數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.biosino.org/

CUTG,密碼子使用頻度表

http://www.dna.affrc.go.jp/~nakamura/CUTG.html

http://www.kazusa.or.jp/codon/

http://www.dna.affrc.go.jp/~nakamura/CUTG.html

EPD,真核生物啟動(dòng)子數(shù)據(jù)庫(kù)（Eukaryotic Promotor Database）

http://www.epd.isb-sib.ch/

TRANSFAC,真核生物基因表達(dá)調(diào)控因子的數(shù)據(jù)庫(kù)

http://transfac.gbf.de/TRANSFAC

TRRD.真核生物基因組轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.mgs.bionet.nsc.ru/mgs/dbases/trrd4/

OOTFD,轉(zhuǎn)錄因子和基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.ifti.org/

RepBase,真核生物DNA中重復(fù)序列數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.girinst.org/~server/repbase.html

MicroSatellite,微衛(wèi)星重復(fù)序列數(shù)據(jù)庫(kù)

http://nmnhgoph.si.edu/gopher-menus/MicroSatelliteDatabase.html

ALU數(shù)據(jù)庫(kù)是人及其他靈長(zhǎng)類代表性的Alu重復(fù)片段

http://ncbi.nlm.nih.gov(/pub/jmc/alu/)

Simple Repeats,簡(jiǎn)單重復(fù)序列庫(kù)

http://ncbi.nlm.nih.gov/

COMPEL,復(fù)合元件數(shù)據(jù)庫(kù)

ftp://ftp.gbf-braunschweig.de(/pub/compel/)

MPDB,分子探針數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.biotech.ist.unige.it/interlab/mpdb.html

HvrBase,靈長(zhǎng)類mtDNA調(diào)控區(qū)序列庫(kù)，主要是人的HVI和HVII兩個(gè)高變異區(qū)的序列http://monolith.eva.mpg.de/hvrbase/

PlantCARE,植物順式作用(cis-acting)調(diào)控因子數(shù)據(jù)庫(kù).

http://sphinx.rug.ac.be:8080/PlantCare/

PLACE是從文獻(xiàn)中搜集的植物順式作用調(diào)控元件DNA模體的數(shù)據(jù)庫(kù),只涉及維管植物.

http://www.dna.affrc.go.jp/htdocs/PLACE/

ftp://ftp.dna.affrc.go.jp(/pub/dna_place/place.seq)

Mendel數(shù)據(jù)庫(kù),搜集植物STS和EST序列.

http://jiio6.jic.bbsrc.ac.uk/

HOX Pro同源異型盒(homeobox)基因數(shù)據(jù)庫(kù).

http://spirov.iephb.nw.ru/hox_pro/hox-pro00.html

OPD,寡核苷酸探針數(shù)據(jù)庫(kù)(Oligonucleotide Probe Database).

http://www.cme.msu.edu/OPD/

dbSTS,序列標(biāo)記位點(diǎn)(Sequence Tagged Sites)數(shù)據(jù)庫(kù).

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbSTS/

ftp://ncbi.nlm.nih.gov(/repository/dbSTS)

dbEST.這是GenBank的重要組成部分,它包含若干物種的已表達(dá)的序列標(biāo)記信息.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST/

ftp://ncbi.nlm.nih.gov(/repository/dbEST)

AmmtDB,后生動(dòng)物線粒體DNA多序列聯(lián)配數(shù)據(jù)庫(kù),搜集了脊椎動(dòng)物線粒體中編碼蛋白質(zhì)和tRNA的多DNA序列對(duì)比數(shù)據(jù),以及哺乳動(dòng)物mtDNA主調(diào)控區(qū)序列聯(lián)配數(shù)據(jù).

http://bio-www.ba.cnr.it:8000/BioWWW/#AMMTDB

HOVERGEN,脊椎動(dòng)物同源基因數(shù)據(jù)庫(kù)(HOmologous VERtebrate GENes)

http://acnuc.univ-lyon1.fr/

ftp://ftp.infobiogen.fr(/pub/db/acnuc/hovergen)

DNA結(jié)構(gòu)參數(shù)庫(kù).

ftp://transfac.gbf.de(/pub/structure_library)

NUCLEOSOME數(shù)據(jù)庫(kù),收集實(shí)驗(yàn)測(cè)定的核小體數(shù)據(jù),用于預(yù)測(cè)DNA中與組蛋白八聚體結(jié)合的位點(diǎn).

ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/nucleosomal_dna/

SELEX_DB,隨機(jī)化序列庫(kù).

http://www.mgs.bionet.nsu.ru/mgs/systems/selex/

ASDB,交替剪接基因的數(shù)據(jù)庫(kù).

http://hattrick.lbl.gov:8888/

Intronerator,秀麗線蟲內(nèi)含子和交替剪接數(shù)據(jù)庫(kù)http://www.cse.ucse.edu/~kent/intronerator/

IDB和IEDB前者是內(nèi)含子序列數(shù)據(jù)庫(kù)，后者是內(nèi)含子演化數(shù)據(jù)庫(kù)http://numeg.bio.indiana.edu/intron/index.html

EID,外顯子、內(nèi)含子數(shù)據(jù)庫(kù)

http://mcb.havard.edu/gilbert/EID/

ExInt,外顯子、內(nèi)含子數(shù)據(jù)庫(kù)

http://intron.bic.nus.edu.sg/rint/exint.html

NDB,核酸晶體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)

ftp://ndbserver.rutgers.edu/

http://dnbserver.rutgers.edu/NDB/ndb.html

VectorDB,載體數(shù)據(jù)庫(kù)

http://vectordb.atcg.com/

Vector和Vector-ig,包分子生物學(xué)常用的許多載體的注釋和序列信息ftp://ncbi.nlm.nig.gov(/repository/vetcor-ig)

ftp://ncbi.nlm.nig.gov(/repository/vector)

四．RNA序列和核糖體數(shù)據(jù)庫(kù)

1993年成立的RNA學(xué)會(huì)，在出版RNA刊物同時(shí)，還維護(hù)著兩個(gè)信息網(wǎng)頁(yè)：

http://www.pitt.edu/~rna1/

http://www.cup.org/Journals/JNLSCAT/rRNA/rna.html

snoRNA,小核仁RNA數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.bio.umass.edu/biochem... noRNA-DataBase.html

Small RNA數(shù)據(jù)庫(kù)

http://mbcr.bcm.tmc.edu/smallRNA/smallrna.html

RNAse P數(shù)據(jù)庫(kù)，包含RNA水解酶P的RNA亞基序列、聯(lián)配、二級(jí)結(jié)構(gòu)和三維模型http://jwbrown.mbio.ncsu.edu/RNAseP/home.html

tmRNA網(wǎng)點(diǎn)包含 tmRNA序列、公認(rèn)蛋白質(zhì)水解標(biāo)記、序列聯(lián)配、確定新tmRNA的導(dǎo)引，以及簡(jiǎn)要綜述等

http://www.indiana.edu/~tmrna/

tmRDB.已經(jīng)聯(lián)配好的、加有注釋的、按親緣關(guān)系排列的tmRNA序列數(shù)據(jù)

http://psyche.uthct.edu/dbs/tmRDB/tmRDB.html

gRNA,導(dǎo)引RNA數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.biochem.mpg.de/~goeringe/

SRPDB,信號(hào)識(shí)別粒子數(shù)據(jù)庫(kù)

http://psyche.uthct.edu/dbs/SRPDB/SRPDB.html

TransTerm,信使RNA的組分和翻譯控制信號(hào)數(shù)據(jù)庫(kù)http://biochem.otago.ac.nz/Transterm/

類病毒和類病毒樣RNA數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.callisto.si.usherb.ca/~jpperra/

UTRdb和UTRsiteUTRdb是真核生物mRNA的5’端和3’端非翻譯區(qū)序列的非冗余數(shù)據(jù)庫(kù)，UTRsite搜集這些非翻譯區(qū)序列中的功能片段

http://bigarea.area.ba.cnr.it:8000/EmbIT/UTRHome/

ncRNA,似mRNA的非編碼RNA數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.man.poznan.pl/5Sdata/ncRNA/index.html

RNAmods,RNA修飾數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www-medlib.med.utah.edu/RNAmods/RNAmods.html

ftp://medlib.med.utah.edu(/library/RNAmods)

AARSDB,酰氨基tRNA合成酶數(shù)據(jù)庫(kù)

http://rose.man.poznan.pl/aars/index.html

tRNA序列和基因、結(jié)構(gòu)與功能數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.uni-bayreuth.de/departments/biochemie/trna/

PLMItRNA基于FastA的綠色植物線粒體tRNA分子和tRNA基因的數(shù)據(jù)庫(kù)

http://bio-www.ba.cnr.it:8000/srs6/

http://www.ebi.ac.uk/services/

16SMDB、16S-likeMDB 、16SMDBexp 、23SMDB、 23S-likeMDBexp數(shù)據(jù)庫(kù)，是一批16S和23S核糖體RNA突變數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.fandm.edu/departments/biology/databasee/rna.html

ftp://acad.fandm.edu(/nar/)

RNA www,RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)網(wǎng)頁(yè)，也有16S RNA和23S RNA的數(shù)據(jù)

http://pundit.colorado.edu:8080/RNA/

uRNADB,已經(jīng)聯(lián)配好的、加有注釋的、按親緣關(guān)系排列的uRNA序列數(shù)據(jù)

http://psyche.uthct.edu/dbs/uRNADB/uRNADB.html

U-insertion/deletion,編輯序列數(shù)據(jù)庫(kù)，包含5個(gè)無(wú)脊椎動(dòng)質(zhì)體目物種的線粒體基因和編輯后的mRNA序列

http://www.lifesci.ucla.edu/RNA/trypanosome/database.html

PseudoBase,假扭結(jié)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.bio.leidenuniv.nl/~Batenburg/PKB.html

RDP,核糖體數(shù)據(jù)庫(kù)計(jì)劃包含小亞基和大亞基的兩部分rRNA,由已聯(lián)配的RNA序列以及親緣樹組成

http://www.cme.smu.edu/RDP/

http://rdpwww.life.uiuc.edu/

http://rdp.life.uiuc.edu(/pub/)

SSU rRNA歐洲核糖體小亞基RNA結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://rrna.uia.ac.be/ssu/

LSU rRNA歐洲核糖體大亞基RNA結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://rrna.uia.ac.be/lsu/

5S rRNA數(shù)據(jù)庫(kù)

http://rose.man.poznan.pl/5Sdata/index.html

DRC,核糖體交鏈數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.mpimg-berlin-dahlem.mpg.de/~ag_ribo/ag_brimacombe/drc/

ACTIVITY,DNA和RNA中功能位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.mgs.bionet.nsu.ru/systems/Activity/

RNA非正則配對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://prion.bchs.uh.edu/bp_type/

五．基因圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)

Rhdb,輻射雜交數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.ebi.ac.uk/RHdb

http://corbra.ebi.ac.uk/Rhdb/species/HUMAN/gm99.html

ftp://ftp.ebi.ac.uk(/pub/databases/RHdb)

Mouse RH數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www-genome.wi.mit.edu/mouse_rh/

GDB,人類基因組數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.gdb.org/

ftp://ftp.gdb.org/

GeneMap’99,人類基因圖譜1999年版

http://www.ncbi.nih.gov/genemap/

HuGeMap,人類基因遺傳圖譜和物理圖譜的分布式集成數(shù)據(jù)庫(kù)

ftp://ftp.ebi.ac.uk(/pub/databases/RHdb/gm99.map)

六．人類基因組有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)

人類染色體數(shù)據(jù)網(wǎng)址：

http://linkage.rockefeller/chr1/

http://www.sanger.ac.uk/HGP/chr1

http://www.sanger.ac.uk/HGP/chr2

http://mars.uthscsa.edu/

http://www.genomics.org.cn/

http://www.sanger.ac.uk/HGP/chr4

http://www.jgi.doe.gov/

http://www.sanger.ac.uk/HGP/chr6

http://www.genet.sickkids.on..ca/chrdb

http://www.gc.bcm.tmc.edu:8080/chr8/home.html

http://www.gene.ucl.ac.uk/chr9

http://www.sanger.ac.uk/HGP/chr9

http://www.cric.com/htdocs/chr10-mapping/

http://www.sanger.ac.uk/HGP/chr10/

http://chr11.bc.ic.ac.uk/

http://mcdermott.swmed.edu/datapage/

http://shows.med.buffalo.edu/database.html

http://paella.med.yale.edu/chr12/home.html

http://genome.ccc.columbia.edu/~genome/

http://www.sanger.ac.uk/HGP/chr13/

http://www.sanger.ac.uk/HGP/chr15/

http://www.sanger.ac.uk/HGP/chr15/

http://www.jgi.doe.gov/

http://www.tigr.org/tdb/humgen/c16.html

http://bioinformatics.weizmann.ac.il/

http://www.sanger.ac.uk/HGP/chr18/

http://www.jgi.doe.gov/

http://www-bio.llnl.gov/bbrp/genome/genome.html

http://www.expasy.ch/cgi-bin/lists?humchr20.txt

http://www.sanger.ac.uk/HGP/chr20/

http://www.expasy.ch/cgi-bin/lists?humchr21.txt

http://www-eri.uchsc.edu/chr21/welcome.html

http://www.cephb.fr/chromosome21.html

http://www.cbil.upenn.edu/HGC22.html

http://www.expasy.ch/cgi-bin/lists?humchr22.txt

http://www.sanger.ac.uk/hum22/HGP/chr22/

http://www.genome.ou.edu/gifs/

http://www.expasy.vh/cgi-bin/lists?humchrx..txt

http://gc.bcm.tmc.edu:8080/chrX/home.html

http://www.sanger.ac.uk/HGP/chrX/

http://www.expasy.ch/cgi-bin/lists?humchry.txt

http://www.infinity.gen.emory.edu/mitomap.html

1．人類基因組測(cè)序中心

HUGO是人類基因組組織的縮寫

http://hugo.gdb.org/

HUGO Pacific GENOME Newsletter 是HUGO在太平洋部分，其中反映中國(guó)情況的短文在：

http://hugo-pacific.genome.ac.jp/3_2contents/china.html

美國(guó)能源部支持的人類基因組計(jì)劃

http://www.er.doe.gov/production/ober/hug_top.html

美國(guó)國(guó)家衛(wèi)生署對(duì)人類基因組計(jì)劃的支持，通過(guò)NHGRI即國(guó)家人類基因組研究所（National Human Genome Research Institute）體現(xiàn)

http://www.nhgri.nih.gov/

英國(guó)Wellcome Trust是人類基因組計(jì)劃的另一個(gè)主要資助者

http://www.wellcome.ac.uk/

百慕大原則：測(cè)序的中間和最終結(jié)果都必須迅速的公開

http://www.gene.ucl.ac.uk/hugo/bermuda.html

世界上主要人類基因組測(cè)序中心的名單

http://www-hgc.lbl.gov/inf/Hgcenters.html

http://www.ornl.gov/hgmis/centers.html

NCBI的GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)從1999年10月起，建立了智人基因組子目錄，其下按染色體編號(hào)設(shè)子目錄

http://ncbi.nlm.nih.gov/genbank/genomes/H_sapiens/

英國(guó)的Sanger中心的人類基因組計(jì)劃網(wǎng)頁(yè)，不僅有它們負(fù)責(zé)測(cè)序的染色體數(shù)據(jù)，還有到其他染色體數(shù)據(jù)的鏈接

http://www.sanger.ac.uk/HGP/

日本的DDBJ和信息生物學(xué)中心（CIB）聯(lián)合建立了一個(gè)Human Genomics Studio，可以按染色體編號(hào)檢索和查找基因序列

http://studio.nig.ac.jp/

Sanger 中心是世界上最大的DAN測(cè)序中心之一承擔(dān)人類基因組計(jì)劃的三分之一，集中在1、6、9、10、13、20、22和X

http://www.sanger.ac.uk/HGP/stats.html

LBNL，Lawrence Berkeley 國(guó)家實(shí)驗(yàn)室

http://www-hgc.lbl.gov/GenomeHome.html

LLNL，Lawrence Livermore 國(guó)家實(shí)驗(yàn)室

http://www-bio.llnl.gov/bbrp/genome/genome.html

LANL，美國(guó)洛斯阿拉莫斯國(guó)家實(shí)驗(yàn)室

http://www-ls.lanl.gov/index.html

JGI，由美國(guó)能源部支持的，依托LBNL、LLNL和LANL三個(gè)國(guó)家實(shí)驗(yàn)室的人類基因組研究部門建的聯(lián)合基因組研究所（Joint Genome Institute）

http://jgi.doe.gov/

UWGC，華盛頓大學(xué)基因中心，是國(guó)際上最活躍的測(cè)序中心之一

http://www.genome.washington.edu/

ftp://ftp.genome.washington.edu/

SHGC，斯坦福大學(xué)人類基因中心，主要做高分辨率輻射雜交圖譜，以及人類第四號(hào)染色體BAC克隆的測(cè)序

http://www-shgc.stanford.edu/

美國(guó)哥倫比亞大學(xué)基因中心，主要研究和人類疾病有關(guān)的基因和第13號(hào)染色體圖譜

http://genome1.ccc.columbia.edu/~genome/

http://genome3.cpmc/columbia.edu/~legion/

GENETHON，法國(guó)人類基因組研究中心

http://www.genethon.fr/genethon_en.html

2．人類基因組有關(guān)數(shù)據(jù)

GenBank、 EMBL 、GSDB 、GDB等綜合數(shù)據(jù)庫(kù)的主要內(nèi)容都來(lái)自人

UniGene,人類基因序列集合，搜集了GenBank中不同基因產(chǎn)物的序列

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/UniGene/

HIB數(shù)據(jù)庫(kù)，是德國(guó)人類基因組計(jì)劃中基因分析項(xiàng)目所建立的自動(dòng)注釋的基因集團(tuán)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.mips.biochem.mpg.de/proj/human/

dbSNP,設(shè)在美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心NCBI的單核苷酸多態(tài)性數(shù)據(jù)庫(kù)，收錄單核苷酸置換，以及短的刪除和插入所導(dǎo)致的多態(tài)性

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/

Whitehead的生物醫(yī)學(xué)研究所的人類單核苷酸多態(tài)性（SNP）數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www-genome.wi.mit.edu/SNP/human

HGBASE是人類雙等位基因序列（Human Genic Bi-Allelic Sequences）的縮寫，這是人類基因從啟動(dòng)子到轉(zhuǎn)錄終點(diǎn)，即基因及其前后所發(fā)現(xiàn)的所有單核苷酸多態(tài)性和其他變化的數(shù)據(jù)庫(kù)

http://hgbase.interactiva.de/

http://hgbase.cgr.ki.se/

位于St.Louis的華盛頓大學(xué)的SNP數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.ibc.wustl.edu/SNP/

I.M.A.G.E協(xié)作組，他們共享高質(zhì)量的cDNA克隆庫(kù)，并把有關(guān)序列、圖譜和表達(dá)數(shù)據(jù)公開

http://www-bio.llnl.gov/bbrp/image/image/html

美國(guó)菌種保藏中心（American Type Culture Collection）

http://www.atcc.org/

GenMapDB,V.Cheung實(shí)驗(yàn)室維護(hù)的一個(gè)BAC圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)

http://w95vcl.neuro.chop.edu/vcheung/

BAC Ends,人類BAC末端數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.tigr.org/tdb/humgen/bac_end_search/

HUGE,人類未經(jīng)實(shí)驗(yàn)證實(shí)的編碼基因的數(shù)據(jù)庫(kù)

http://dazusa.or.jp/huge/

IXDB,集成的人類X染色體物理圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)

http://ixdb.mpimp-berlin-dahlem.mpg.de/

Genotype,法國(guó)人類多態(tài)性研究中心的基因型數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.cephb.fr/cephdb/

VIRGIL,專門為GDB中的人類基因和GenBank中的DNA序列提供對(duì)應(yīng)鏈接關(guān)系的數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.infobiogen.fr/services/birgil/Hpvirgil.html

ftp://ftp.infobiogen.fr(/pub/db/viogil/virgil.ffl)

KinMutBase,人類致病蛋白質(zhì)激酶突變數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.uta.fi/imt/bioinfo/KinMutBase/

CpGIsle,人類基因中CpG島數(shù)據(jù)庫(kù)

ftp://bioslave.uio.no(/cpgisle)

ftp://ftp.infobiogen.fr(/pub/db/cpgisle/)

ftp://ftp.ebi.ac.uk(/pub/databases/cpgisle)

p53數(shù)據(jù)庫(kù)研究人類腫瘤及腫瘤細(xì)胞系p53基因突變的數(shù)據(jù)庫(kù)，包括：p53庫(kù)、體細(xì)胞突變庫(kù)、種系突變庫(kù)和細(xì)胞系突變庫(kù)

http://perso.curie.fr/tsoussi/

IARC p53數(shù)據(jù)庫(kù)法國(guó)國(guó)際癌癥研究會(huì)的腫瘤和細(xì)胞系P53基因突變數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.iarc.fr/p53/homepage.html

http://www.ebi.ac.uk/

p53數(shù)據(jù)庫(kù)具有癌癥傾向家族P53種系突變數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.lf2.cuni.cz/projicts/germline_mu_p53.html

ftp://ftp.lf2.cuni.cz(/pub/doc/medical/)

人類P53基因突變及軟件

http://metalab.unc.edu/dnam/des_p53.html

人類hprt即次嘌呤磷酸核糖基轉(zhuǎn)移酶基因突變數(shù)據(jù)庫(kù)和在PC視窗下運(yùn)行的分析軟件

http://metalab.unc.edu/dnam/des_hprt.html

轉(zhuǎn)基因嚙齒動(dòng)物L(fēng)acI數(shù)據(jù)庫(kù)

http://metalab.unc.edu/dnam/des_laci.html

轉(zhuǎn)基因嚙齒動(dòng)物L(fēng)acZ突變庫(kù)基因突變數(shù)據(jù)庫(kù)及分析軟件

http://matalab.unc.edu/dnam/des_lacz.html

WRN基因突變與遺傳病Werner綜合征有關(guān)

http://www.pathology.washington.edu/werner/ws-wrn.html

OMIM,在線人類孟德爾遺傳數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www3.ncbi.nlm.nih.gov/omim/

STACK,南非國(guó)家信息中心SANBI維護(hù)的一個(gè)序列標(biāo)記聯(lián)配和代表序列知識(shí)庫(kù)

http://www.sanbi.ac.za/Dbases.html

SANIGENE是與STACK密切相關(guān)的一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)它包含所有經(jīng)過(guò)計(jì)算機(jī)處理聯(lián)配過(guò)的人類基因EST的集團(tuán)

http://www.sanbi.ac.za/Dbases.html

七．其他物種基因組數(shù)據(jù)庫(kù)

DOGS，基因組尺寸數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.cbs.dtu.dk/

GenBank的/genomes/子目錄：

ftp://ftp.cbi.pku.edu.cn(/pub/databases/genband/genomes/)

EuGenes,真核生物基因綜合知識(shí)庫(kù)，目前包括果蠅、人、小鼠、擬南芥、線蟲、酵母、和斑馬魚的數(shù)據(jù)

http://iubio.bio.indiana.edu/eugenes

1.原核生物基因組

細(xì)菌基因組計(jì)劃的進(jìn)展情況，可從以下網(wǎng)站查詢：

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PMGifs/Genomes/bact.html

MOT ，歐洲生物信息研究所EBI的基因組測(cè)序進(jìn)展表

http://www.ebi.ac.uk/~sterk/genome-MOT/

GIB，日本DDBJ設(shè)立的Genome Information Broker for microbial genomes 的縮寫

http://mol.genes.nig.ac.jp/gib/

MAGPIE測(cè)序計(jì)劃清單也可以參考

http://www-fp.mcs.anl.gov/~gaasterland/genomes.html

EMGLib,增補(bǔ)微生物基因組庫(kù)

http://pbil.univ-lyon1.fr/emglib/emglib.html

大腸桿菌K12菌株的完全基因組序列，可由GenBank的子目錄/genomes/獲取，或從華盛頓大學(xué)大腸桿菌基因組中心，即Blattner實(shí)驗(yàn)室的網(wǎng)頁(yè)讀?。?/p>

http://www.genetics.wisc.edu/pub/sequence/

ECDC,大腸桿菌菌株K12的基因序列庫(kù)，包括基因、讀框、調(diào)控區(qū)、啟動(dòng)子、終止子、tRNA和rRNA等

http://susi.bio.uni-giessen.de/ecdc/ecdc.html

ftp://ftp.ebi.ac.uk)/pub/databases/ecdc)

EcoGene和EcoWeb,大腸桿菌K12菌株基因組數(shù)據(jù)庫(kù)，包括基因、蛋白質(zhì)、基因間蛋白質(zhì)組信息

http://bmb.med.miami.edu/EcoGene/EcoWeb/

RegulonDB,大腸桿菌轉(zhuǎn)錄調(diào)控和操作子數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.cifn.unam.mx/Computational_Biology/regulondb/

NRSub,非冗余枯草芽孢桿菌DNA數(shù)據(jù)庫(kù)，包括完全基因組、密碼子使用表、基因圖譜和基因家族

http://acnuc.univ-lyon1.fr/nrsub/nrsub.html

ftp://ftplnig.ac.jp(/pub/db/nrsub)

HIDB,流感嗜血菌完全基因組的原始數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.tigr.org/tdb/mdb/hidb/hidb.html

ftp://ftp.tigr.org/pub/data/h_influenzae

HIDC,流感署血菌基因序列庫(kù)

http://susi.bio.uni-giessen.de/ecdc/hidc.html

CyanoBase,藍(lán)細(xì)菌數(shù)據(jù)庫(kù)，實(shí)際上是集胞藍(lán)細(xì)菌的基因組數(shù)據(jù)庫(kù)藍(lán)細(xì)菌具有氧化和光合作用所需的全套基因

http://www.kazusa.or.jp/cyano/cyano.html

MJDB,詹氏甲烷球菌基因組數(shù)據(jù)庫(kù)

ftp://ftp.tigr.org(/pub/data/m_jannaschii)

http://www.tigr.org/tdb/mdb/mjdb/mjdb.html

MycDB,分枝桿菌數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.biochem.kth.se/MycDB.html

RsGDB,類球紅細(xì)菌基因組數(shù)據(jù)庫(kù)第一作者聯(lián)系：

mailto:/madhu@utmmg.med.uth.tmc.edu

PGI,疫霉屬基因預(yù)研究計(jì)劃的數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.ncgr.org/pgi/

2.真菌基因組

SGS,釀酒酵母基因組數(shù)據(jù)庫(kù)

http://genome-www.standford.edu/Saccharomyces/

ftp://genome-ftp.stanford.edu(/pub/yeast)

LISTA,LISTA-HOP和LISTA-HON是釀酒酵母基因組中蛋白質(zhì)編碼序列及其同源性的數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.ch.embnet.org/

ftp://bioftp.unibas.ch/

MYGD,酵母基因組、蛋白質(zhì)和同源關(guān)系的數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.mips.biochem.mpg.de/proj/yeast/

YIDB,酵母內(nèi)含子數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.EMBL-Heidelberg.DE/ExternalInfo/seraphin/yidb.html

MNCDB,由德國(guó)MIPS所維護(hù)的粗糙鏈孢霉基因組數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.mips.biochem.mpg.de/desc/neurospora/

真菌基因組資源的網(wǎng)址：

http://fungus.genetics.uga.edu:5080/main.html

FGSC,真菌遺傳學(xué)信息中心

http://www.fgsc.net/

3.原生生物和線蟲基因組

歐洲生物信息研究所EBI的原生生物網(wǎng)頁(yè)：

http://www.ebi.ac.uk/Projects/Protozoa/

AceDB,線蟲綜合數(shù)據(jù)庫(kù)

ftp://sanger.ac.uk(/pub/acedb)

ftp://ncbi.nlm.nih.gov(repository/acedb)

ftp://lirmm.lirmm.fr(/pub/acedb)

關(guān)于線蟲發(fā)育特別是化學(xué)感覺神經(jīng)的研究

http://devbio-mac1.ucsf.edu/

4.昆蟲基因組

斯坦福大學(xué)的果蠅基因組中心

http://www.fruitfly.org/

FlyBase,果蠅基因和分子數(shù)據(jù)庫(kù)

http://flybase.bio.indiana.edu/

ftp://flybase.bio.indiana.edu/

FlyNets,果蠅分子和遺傳相互作用數(shù)據(jù)庫(kù)

http://gifts.univ-mrs.fr/FlyNets/

GIF-DB,果蠅胚胎發(fā)育過(guò)程中基因相互作用的WWW數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www-biol.univ-mrs.fr/~lgpd/GIFTS_home_page.html

哈佛大學(xué)的果蠅網(wǎng)頁(yè)

http://morgan.harvard.edu/

MsqDB,蚊子基因數(shù)據(jù)庫(kù)

http://klab.agsci.colostate.edu/acedb/MsqDB-acedb.html

ftp://klab.agsci.colostate.edu/

5.魚類數(shù)據(jù)庫(kù)

美國(guó)國(guó)家衛(wèi)生署1997年建立的斑馬魚網(wǎng)頁(yè)

http://www.nih.gov/science/models/zebrafish/

ZFIN,斑馬魚基因組、發(fā)育突變和野生種系數(shù)據(jù)庫(kù)

http://zfish.uoregon.edu/ZFIN/

Fugu是河豚的數(shù)據(jù)庫(kù)

http://fugu.hgmp.mrc.ac.uk/

6.嚙齒動(dòng)物基因組

下面是有關(guān)家鼠的數(shù)據(jù)庫(kù)

M.Musculus基因組庫(kù)

ftp://ncbi.nlm.mih.gov(/genbank/genomes/M_muslulus)

MGD,家鼠基因組庫(kù)，現(xiàn)在又稱MGI即家鼠基因組信息庫(kù)

http://www.informatics.jax.org/mgd.html

ftp://ftp.informatics.jax.org/

Cre轉(zhuǎn)基因家鼠系的數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.chinainfo.gov.cn/periodical/yc/yc9903/990314html

RatMap,大鼠基因圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)

http://ratmap.gen.gu.se/

7.細(xì)胞器數(shù)據(jù)庫(kù)

主要是線粒體和葉綠體基因的數(shù)據(jù)

MitoNuc和MitoAln是關(guān)于編碼線粒體蛋白的細(xì)胞核基因的兩個(gè)相互關(guān)聯(lián)的數(shù)據(jù)庫(kù)

http://bio-www.ba.cnr.it:8000/srs6/

GOBASE,細(xì)胞器基因組數(shù)據(jù)庫(kù)

http://megasun.bch.umontreal.ca/gobase/

MitBASE,線粒體DNA數(shù)據(jù)庫(kù)，集成所有已知線粒體基因信息

http://www3.ebi.ac.uk/Research/Mitbase/mitbase.pl/

人類線粒體數(shù)據(jù)庫(kù)

http://bio-www.ba.cnr.it8000/Tutorials/MitBASE/

MitBASE Pilot,酵母線粒體中核基因數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www3.ebi.ac.uk/Research/Mitbase/mitbase.pl/

植物和藻類線粒體數(shù)據(jù)庫(kù)

http://tomic.ebi.ac.uk:8889/mitb... .pla_show_qry_opts/

原生生物線粒體數(shù)據(jù)庫(kù)

http://bio-www.ba.cnr.it:8000/Tu... /protist_table.html

脊椎動(dòng)物線粒體數(shù)據(jù)庫(kù)

http://bio-www.ba.cnr.it:8000/Tutorials/MitBASE/vertebrate.html

8.擬南芥基因組

MATDB,國(guó)際擬南芥基因組計(jì)劃的數(shù)據(jù)匯總

http://www.mips.biochem.mrg.de/desc/thal/

AtDB,擬南芥基因組數(shù)據(jù)庫(kù)

http://genome-www.stanford.edu/Arabidopsis/

ftp://genome-ftp.stanford.edu(/pub/arabidopsis)

DatA,擬南芥基因組注釋庫(kù)

http://luggagefast.Stanford.edu/group/arabprotein/

TAIR,擬南芥信息資源

http://www.arabidopsis.org/

AGR,擬南芥基因組資源

http://synteny.nott.ac.uk/agr/agr.html

TIGR-AT，TIGR研究所的似南芥EST和基因序列數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.tigr.org/tdb/at/at.html

9.病毒數(shù)據(jù)庫(kù)

ICTVdB,病毒數(shù)據(jù)庫(kù)

http://life.anu.edu.au/viruses/ICTVdB/ictvdb.html

VIDEdB,病毒鑒定交換數(shù)據(jù)庫(kù)

http://biology.anu.edu.au/research-groups/MES/vide/

RDV,水稻矮縮病毒基因組數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.cbi.pku.edu.cn/rdv/

八．蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)

SWISS-PROT是對(duì)數(shù)據(jù)人工審讀很嚴(yán)格的庫(kù)

http://www.expasy.ch/sprot/

TrEMBL是從EMBL庫(kù)中的核酸序列翻譯出來(lái)的氨基酸序列，已經(jīng)完成了自動(dòng)注釋

http://www.ebi.ac.uk:5000/

PIR是蛋白質(zhì)信息資源的縮寫

http://www-nbrf.georgetown.edu/pir/

http://www.mips.biochem.mpg.de/proj/protseqdb/

GenBank是由GenBank中的DNA序列翻譯得到的蛋白質(zhì)序列，與TrEMBL相似、但沒(méi)有像后者那樣經(jīng)專家審讀

http://www.infobiogen.fr/srs/

PROSITE,由專家根據(jù)生物知識(shí)審編的SWISS-PROT蛋白質(zhì)序列中有生物意義的位點(diǎn)、模式和輪廓的數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.expasy.ch/prosite/

PrositeScan服務(wù)器，根據(jù)用戶填表提交的蛋白質(zhì)序列搜索PROSITE模式

http://www.isrec.isb-sib.ch/software/PSTSCAN_form.html

PSD,蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)，是PIR的主體

http://pir.georgetown.edu/pirwww/dbinfo/texpsd.html

PATCHX,PIR的子庫(kù)之一，收入尚未納入PIR庫(kù)的蛋白質(zhì)序列

http://pir.georgetown.edu/pirwww/dbinfo/patchx.html

ARCHIVE,PIR的子庫(kù)之一，保存PIR庫(kù)中條目的原始文獻(xiàn)或最初提交的序列

http://pir.georgetown.edu/pirwww/dbinfo/achive.html

ProClass,蛋白質(zhì)類數(shù)據(jù)庫(kù)，是根據(jù)PROSITE庫(kù)和PIR庫(kù)中超家族的關(guān)系組織起來(lái)的非冗余蛋白質(zhì)庫(kù)

http://pir.georgetown.edu/gsfserver/prolclass.html

http://diana.uthct.edu/proclass.html

PIR-ASDB,PIR的注釋和相似性數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www-nbrf.georgetown.edu/por/

KIND,瑞典斯德哥爾摩生物信息中心維護(hù)的非冗余蛋白質(zhì)序列庫(kù)

ftp://ftp.mbb.ki.se(/pub/KIND)

ENZYME,基于命名系統(tǒng)的酶數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.expasy.ch/enzyme/

BRENDA,這是一個(gè)內(nèi)容廣泛的酶的信息庫(kù)

http://www.brenda.uni-koeln.de/

OWL,蛋白質(zhì)序列庫(kù)，是由SWISS-PROT，PIR，GenBank翻譯序列和PDB等數(shù)據(jù)庫(kù)產(chǎn)生的非冗余的蛋白質(zhì)序列庫(kù)

http://bmbsgi11.leeds.ac.uk/bmb5dp/owl.html

GeneCards,由以色列魏茨曼科學(xué)研究所維護(hù)的關(guān)于基因及其產(chǎn)物，以及它們的生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用的文獻(xiàn)庫(kù)

http://bioinfo.weizmann.ac.il/cards

SWISS-2DPAGE,由二維聚丙烯酰胺凝膠電泳所確定的蛋白質(zhì)的參考圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)，包括文本和圖象信息，通向其他2D-PAGE數(shù)據(jù)庫(kù)的鏈接等

http://www.expasy.ch/ch2d/

HDB,組蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)，包括聯(lián)配好的組蛋白序列以及已確認(rèn)包含有組蛋白折疊模體的非蛋白序列，以及所有已知組蛋白和組蛋白質(zhì)折疊的結(jié)構(gòu)，同時(shí)指出不同數(shù)據(jù)庫(kù)中類似序列的差異

http://genome.nhgri.nih.gov/histones/

HOBACGEN數(shù)據(jù)庫(kù)，包含按家族組織的所有細(xì)菌的蛋白質(zhì)序列，有助于從各種細(xì)菌選取同源家族，作多序列聯(lián)配和構(gòu)建親緣樹

http://www.mips.biochem.mpg.de/proj/medgen/mitop/

MITOP,線粒體蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù)，包括線粒體有關(guān)的基因、蛋白質(zhì)和疾病信息

http://www3.ebi.ac.uk/Research/Mitbase/mitbase.pl/

MITOMAP,人類線粒體基因組數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.gen.emory.edu/mitomap.html

REBASE,限制性內(nèi)切酶和甲基化酶數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.neb.com/rebase

ProtoMap,蛋白質(zhì)分類數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.protomap.cs.huji.ac.il/

ISSD蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.protein.bio.msu.su/issd/

PRF,日本蛋白質(zhì)研究基金會(huì)維護(hù)著三個(gè)蛋白質(zhì)和多肽數(shù)據(jù)庫(kù)：PRF/LITDB文獻(xiàn)庫(kù)、PRF/SEQDB序列庫(kù)及PRF/SYNDB合成產(chǎn)物庫(kù)

http://prfsun2.prf.or.jp/

MEROPS,肽酶數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.bi.bbsrc.ac.uk/Merops/Merops.html

PKR,蛋白激酶信息庫(kù)

http://www.sdsc.edu/Kinases/pkr/pkk_catalytic/pk_cat_list.html

Wnt基因網(wǎng)頁(yè)

http://vonbaer.ana.ed.ac.uk/rnusse/wntwindow.html

PhosphoBase,磷酸化位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.cbs.dtu.dk/databases/PhosphoBase/

SYSTERS,蛋白質(zhì)集團(tuán)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.dkfz-heidelberg.de/tbi/services/cluster/

DIP蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫(kù)

http://URLdip.doe-mbi.ucla.edu/

DexH/D數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.columbia.edu/~ej67/dbhome.htm

Homeodomain,同源異形結(jié)構(gòu)域數(shù)據(jù)庫(kù)

http://genome.nhgri.gov/homeodomain/

InBase,新英格蘭生物實(shí)驗(yàn)公司的蛋白質(zhì)剪接數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.neb.com/neb/inteins.html

LGICdb,配體門控離子通道數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.pasteur.fr/recherche/banques/LGIC/LGIC.html

SENTRA,信號(hào)傳遞蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://wit.mcs.anl.gov/WIT2/Sentra/

ICN,離子通道網(wǎng)絡(luò)，是由美國(guó)神經(jīng)科學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)中心等單位聯(lián)合建立的一個(gè)內(nèi)容豐富的網(wǎng)頁(yè)

http://pain.med.umn.edu/csn/

Aaindex,氨基酸索引數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.genome.ad.jp/aaindex/

九、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和分類數(shù)據(jù)庫(kù)

PDB,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.rcsb.org/pdb/

RCSB,結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)信息學(xué)合作研究組織

http://www.rcsb.org/

PDBNEW,下一版PDB庫(kù)正式發(fā)布前收到的全新或更新條目

http://www.pdb.bnl.gov/

PDBFinder,在PDB、DSSP、HSSP、基礎(chǔ)上建立的二級(jí)庫(kù)，包含PDB序列、作者、R因子、分辨率、二級(jí)結(jié)構(gòu)等

http://www.sander.embl-heidelberg.de/pdbfinder/

ftp://swift/embl-heidelberg.de(/pdbfinder)

PDB at a Glance清單

http://cmm.info.nih.gov/modeling/pdb_at_a_glance.html

PDBselect數(shù)據(jù)庫(kù)

http://swift.embl-heidelberg.de/pdbsel/

PDBsum是PDB庫(kù)中數(shù)據(jù)的更便于閱讀的總結(jié)和分析，以及一些衍生數(shù)據(jù)

http://www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/pdbsum/index.html

BioMagResBank簡(jiǎn)稱BMRB，是關(guān)于多肽、蛋白質(zhì)和核酸的核磁共振數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.bmrb.wisc.edu/

CSD,劍橋結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.ccdc.cam.ac.uk/prods/csd.html

NRL-3D,三維結(jié)構(gòu)已經(jīng)確定的蛋白質(zhì)序列庫(kù)

http://www.gdb.org/Dan/proteins/nr13d.html

FAMBASE,,是每個(gè)蛋白質(zhì)家族的代表序列的集合，它有助于加速同源性搜索

http://pir.georgetown.edu/pirwww/dbinfo/fambase.html

ProtFam,蛋白質(zhì)超家族的序列聯(lián)配數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.mips.biochem.mpg.de/proj/protfam/protfam/

SCOP,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分類數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.ipc.pku.edu.cn/scop/

CATH,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能關(guān)系分類數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/cath/

PIR-ALN,蛋白質(zhì)序列聯(lián)配數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www-nbrf.georgetown.edu/pir/alndb.html

3Dee,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域定義的數(shù)據(jù)庫(kù)

http://circinus.ebi.ac.uk:8080/3Dee/

ProTherm,蛋白質(zhì)及其變異體熱力學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.rtc.riken.go.jp/protherm.html

ASTRAL是基于SCOP數(shù)據(jù)庫(kù)的一組分析蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和蛋白質(zhì)序列的數(shù)據(jù)庫(kù)和工具

http://astral.stanford.edu/

RESID,蛋白質(zhì)翻譯后修飾情況的數(shù)據(jù)庫(kù)

http://pir.georgetown.edu/pirwww/search/textresid.html

SMART是簡(jiǎn)單模塊構(gòu)架搜索工具的縮寫

http://SMART.embl-heidelberg.de/

PROMISE數(shù)據(jù)庫(kù)

http://bmbsgi11.leeds.ac.uk/bmbknd/promise/MAIN.html

MMDB蛋白質(zhì)分子模型數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/

VAST矢量聯(lián)配搜索工具

http://swift.embl-heidelberg.de/dssp/

DSSP,PDB庫(kù)中所有蛋白質(zhì)條目的二級(jí)結(jié)構(gòu)歸屬數(shù)據(jù)庫(kù)

http://swift.embl-heidelberg.de/dssp/

HSSP,按同源性導(dǎo)出的蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.sander.embl-heidelberg.de/hssp/

Dali/FSSP,基于PDB數(shù)據(jù)庫(kù)中現(xiàn)有蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)，用自動(dòng)結(jié)構(gòu)對(duì)比程序Dali逐一比較而形成的折疊單元和家族分類庫(kù)

http://www.embl-ebi.ac.ul/dali/

http://croma.ebi.ac.uk/dali/fssp/

3d_ali數(shù)據(jù)庫(kù)，搜集彼此相關(guān)的蛋白質(zhì)序列和結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)

http://www.embl-heidelberg.de/argos/ali/ali.html

DEF蛋白質(zhì)折疊類的預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://zeus.cs.uoi.gr/neural/biocomputing/def.html

INFOGENE,Sanger中心計(jì)算基因組學(xué)小組維護(hù)的、各基因組測(cè)序計(jì)劃所提供的序列中已知的蛋白質(zhì)和預(yù)測(cè)出的基因與蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù)庫(kù)

http://genomic.sanger.ac.uk/inf/infodb.html

TMBase,跨膜蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)

ftp://ulrec3.unil.ch(/pub/tmbase)

PRESAGE是關(guān)于結(jié)構(gòu)基因組學(xué)的一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)，它為庫(kù)中每個(gè)蛋白質(zhì)搜集了反映當(dāng)前實(shí)驗(yàn)狀況、結(jié)構(gòu)、模型和研究建議的注釋

http://presage.stanford.edu/

SBASE,帶有注釋的蛋白質(zhì)序列片、即蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域的數(shù)據(jù)庫(kù)，由ICGEB建立和維護(hù)

http://www.icgeb.trieste.it/sbase/

InterPro,集成的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域和功能位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.ebi.ac.uk/interpro/

HITS,瑞士新近建立的一個(gè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.isrec.isb-sib.ch/cgi-bin/hits/hits_index

BLOCKS,蛋白質(zhì)分類與同源性數(shù)據(jù)庫(kù)，包含蛋白質(zhì)家族中保守區(qū)域的組塊多序列聯(lián)配的數(shù)據(jù)

http://www.blocks.fhcrc.org/

BLOCKS+數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.blocks.fhcrc.org/

PFAM高質(zhì)量的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域家族數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.sanger.ac.uk/Sorfware/Wise2/

PRINTS數(shù)據(jù)庫(kù)最近改名為PRINTS-S，這是一個(gè)蛋白質(zhì)家族的指紋和模體數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.bioinfo.man.ac.uk/dbbrowser/PRINTS/

ProDom自動(dòng)產(chǎn)生的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域家族數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.toulouse.inra.fr/prodom.html

DOMO,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.infobiogen.fr/services/domo/

GRBase,這是參與基因調(diào)控的蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.access.digex.net/~regulate/

PMD,蛋白質(zhì)突變體數(shù)據(jù)庫(kù)

http://pmd.ddbj.nig.ac.jp/

GLYCBASE,蛋白質(zhì)糖基化位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.cbs.dtu.dk/databases/OGLYCBASE/

ORDB嗅覺受體蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)

http://ycmi.med.yale.edu/senselab/ordb/

CarbBank亦稱CCSD，復(fù)雜碳水化合物結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)，通常與蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)歸在一起

http://www.ccrc.uga.edu/

SWISS-3DIMAGE,蛋白質(zhì)三維圖象和PDB瀏覽器

http://www.expasy.ch/sw3d/

IMB,大分子三維圖象庫(kù)

http://www.imb-jena.de/IMAGE.html

BioImage,多維生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www-embl.bioimage.org/

MolMovDB,耶魯大學(xué)的生物信息學(xué)研究室維護(hù)的分子運(yùn)動(dòng)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://bioinfo.mbb.yale.edu/MolMovDB/

ModBase,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)模型比較數(shù)據(jù)庫(kù)

http://pipe.ruckefeller.edu/modbase/

十．比較基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)

COG直系同源聚類數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/COG/

GeneCensus,耶魯大學(xué)生物信息學(xué)研究室維護(hù)的各物種基因組的比較數(shù)據(jù)庫(kù)，著重于折疊單元的結(jié)構(gòu)對(duì)比

http://ncbi.nlm.nih.gov/XREFdb/

XREFdb,哺乳動(dòng)物和模式生物的基因和遺傳學(xué)交叉引用數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.proteome.com/YPDhome.html

YPD,釀酒酵母蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.proteome.com/YPDhome.html

WormPD,線蟲蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.proteome.com/YPDhome.html

十一．基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)

Flyview,果蠅基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://flyview.uni-muenster.de/

Flybrain,果蠅神經(jīng)系統(tǒng)圖譜和數(shù)據(jù)庫(kù)

http://flybrain.uni-freiburg.de/

NEXTDB,線蟲基因表達(dá)模式數(shù)據(jù)庫(kù)

http://watsom.genes.nig.ac.jp:8080/db/

MAGEST數(shù)據(jù)庫(kù)，其名字來(lái)自Maboya Gene Expression patters and Sequence Tags 短語(yǔ)的縮寫

http://star.scl.kyoto-u.ac.jp/magest/

BodyMap,人類和家鼠基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://bodymap.ims.u-tokyo.ac.jp/

Axeldb,非洲爪蟾基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.dkfz-heidelberg.de/abt0135/axeldb.html

XMMR,非洲爪分子標(biāo)記資源

http://vize222.zo.utexas.edu/

TRIPLES,酵母基因功能數(shù)據(jù)庫(kù)，設(shè)在耶魯大學(xué)醫(yī)學(xué)院的基因組分析中心

http://ygac.med.yale.edu/triples/

MGEIR,集成的家鼠基因表達(dá)信息資源

http://genex.hgu.mrc.ac.uk/

GXD,家鼠基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.informatics.jax.org/searches/gxdindex_form.html

EpoDB,脊椎動(dòng)物紅細(xì)胞生成基因表達(dá)分析數(shù)據(jù)庫(kù)

http://cbil.humgen.upenn.edu/epodb/

KidneyDB,腎臟發(fā)育數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.ana.ed.ac.uk/anatomy/kidbase/kidhome.html

ToothExp,牙齒基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://honeybee.helsinki.fi/toothexp/toothexp.html

十二.基因突變、病理和免疫數(shù)據(jù)庫(kù)

HGMD人類基因突變數(shù)據(jù)庫(kù)，可用于預(yù)測(cè)基因疾病

http://uwcm.web.cf.ac.uk/uwcm/mg/hgmd0.html

Marfan人類FBN1基因突變數(shù)據(jù)庫(kù)及分析軟件

http://uwcm.web.cf.ac.uk/uwcm/mg/hgmd0.html

Collagen人類膠原數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.le.ac.uk//genetics/collagen/

人類PAX2等位基因變異數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.hgu.mrc.ac.uk/Softdata/PAX2/

人類PAX6等位基因突變數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.hgu.mrc.ac.uk/Softdata.PAX6/

Androgen雄激素受體突變數(shù)據(jù)庫(kù)，包含與男性性器官發(fā)育不良、前列腺癌等有關(guān)圖譜，密度、頻度以及基因型和表現(xiàn)型關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)

http://www.mcgill.ca/androgendb/

ALFRED為Allele FREquency Database 的縮寫這是由耶魯大學(xué)K.K.Kidd實(shí)驗(yàn)室維護(hù)的一個(gè)針對(duì)人口多樣性和DNA多態(tài)性的等位基因數(shù)據(jù)庫(kù)

http://alfred.med.yale.edu/alfred/

CD40LBASE,CD40L基因突變數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.expasy.ch/cd40lbase/

KMDB由日本慶應(yīng)義塾大學(xué)醫(yī)學(xué)院建立的一組與人類疾病有關(guān)的基因突變數(shù)據(jù)庫(kù)

http://mutview.dmb.med.keio.ac.jp/

KMeyeDB人類疾病和眼病基因突變?nèi)祟愋呐K病基因突變數(shù)據(jù)庫(kù)

http://mutview.dmb.med.keio.ac.jp/mutview3/kmeyedb/

KMearDB人類耳病基因突變數(shù)據(jù)庫(kù)

http://mutview.dmb.med.keio.ac.jp/

KMbrainDB人類腦病基因突變數(shù)據(jù)庫(kù)

http://mutview.dmb.med.keio.ac.jp/

KMcancerDB人類癌癥基因突變數(shù)據(jù)庫(kù)

http://mutview.dmb.med.keio.ac.jp/

OMIA是一大批動(dòng)物的孟德爾遺傳、疾病、基因型和表現(xiàn)型的數(shù)據(jù)庫(kù)

http://wwwlangis.su.oz.au/BIRX/omia/omia_form.html

Atlas法國(guó)建立的針對(duì)腫瘤學(xué)和血液學(xué)的遺傳與細(xì)胞遺傳交互數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.infobiogen.fr/services/chromcancer/

HAMSTeRS凝血因子VIII結(jié)構(gòu)和突變位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://europium.mrc.rpms.ac.uk/

HaemB,B型血友病凝血因子IX點(diǎn)突變和短插入或刪除序列的數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.umsd.ac.uk/molgen/haemBdbatabase.html

TTMD轉(zhuǎn)基因動(dòng)物和靶突變數(shù)據(jù)庫(kù)

http://tbase.jax.org/

FIMM功能分子免疫學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://sdmc.krdl.org.sg:8080/fimm/

MTB家鼠腫瘤生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://tumor.informatics.jax.org/

BCGD人類乳腺癌基因數(shù)據(jù)庫(kù)

http://condor.bcm.tmc.edu/ermb/bcgd/bcgd.html

PAH是導(dǎo)致人類苯丙酮尿癥的苯丙氨酸羥化酶特異位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.mcgill.ca/pahdb/

CFTR,囊性纖維變跨膜調(diào)控子突變數(shù)據(jù)庫(kù)

http://genet.sickkids.on.ca/cftr/

NRR核受體資源計(jì)劃，包括糖類皮酯激素、礦質(zhì)腎上腺皮質(zhì)激素、甲狀腺激素、維生素D受體、類固醇受體等信息的數(shù)據(jù)庫(kù)

http://nrr.georgetown.edu/nrr/nrr.html

IMGT1989年建立的國(guó)際免疫遺傳學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://imgt.cines.fr:8104/

HIG,Anthony Nolan 骨髓和白血病基金會(huì)的人類白細(xì)胞抗體HLA住處30年前由E.A.Kabat建立的具有免疫學(xué)意義的蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.anthonynolan.com/HIG/

PEDB前列腺表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.mbt.washington.edu/PEDB/

HIV,艾滋病分子免疫學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://hiv-web.lanl.gov/immunology/immuno-main.html

斯坦福大學(xué)的HIV RT數(shù)據(jù)庫(kù)，包含幾乎全部已發(fā)表的HIV ＲＴ和蛋白酶序列，是研究抗HIV藥物靶分子演化和與藥物有關(guān)變化的原始資料

http://hivdb.stanford.edu.hiv/

十三．代謝途徑和細(xì)胞調(diào)控?cái)?shù)據(jù)庫(kù)

WIT是What Is There的縮寫是美國(guó)阿貢國(guó)家實(shí)驗(yàn)室的一個(gè)集成的重構(gòu)代謝途徑和模型的系統(tǒng)

http://www.cme.msu.edu/WIT/

EMP是酶與代謝途徑的縮寫

http://biobase.com/emphome.html/

MPW代謝途徑數(shù)據(jù)庫(kù)，是EMP庫(kù)的一個(gè)子集

http://www.cme.msu.edu/MPW/

PUGA原是單細(xì)胞生物代謝途徑親緣聯(lián)配數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.msc.anl.gov/home/compbio/PUMA/

EcoCyc數(shù)據(jù)庫(kù)和MetaCyc數(shù)據(jù)庫(kù)

http://ecocyc.panbio.com/ecocyc/

PathDB,代謝途徑數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.ncgr.org/Software/pathdb/

KEGG,京都基因與基因組百科全書，它包含核酸分子、蛋白質(zhì)序列、基因表達(dá)、基因組圖譜、代謝途徑圖等

http://www.genome.ac.jp/kegg/

由Boehringer Mannheim公司提供的代謝途徑圖，懸掛在許多生化實(shí)驗(yàn)室的墻壁上

http://www.expasy.ch/cgi-bin/search-biochem-index/

SMILES是一個(gè)輔助性數(shù)據(jù)庫(kù)，它搜集與代謝途徑有關(guān)的化合物名稱

http://www.daylight.com/dayhtml/smiles/

LIGAND,酶反應(yīng)化學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)，由日本京都大學(xué)化學(xué)研究所維護(hù)

http://www.genome.ad.jp/htbin/show_man?ligand

CSNDB細(xì)胞中信號(hào)網(wǎng)絡(luò)的數(shù)據(jù)庫(kù)

http://geo.nihs.go.jp/csndb/

Biocatalysis/Biodegradation生物催化和生物降解數(shù)據(jù)庫(kù)

http://dragon.labmed.umn.edu/~lynda/index.html

十四．與農(nóng)林牧有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)

美國(guó)農(nóng)業(yè)部國(guó)家農(nóng)業(yè)圖書館基因組信息系統(tǒng)，它本身的服務(wù)器基于AceDB

http://probe.nalusda.gov:8000/

ARS農(nóng)業(yè)研究服務(wù)處新設(shè)立在康奈爾大學(xué)的USDA-ARS生物信息學(xué)和比較基因組學(xué)中心，ARS是Agricultural Research Service的縮寫

http://ars-genome.cornell.edu/

AgDB農(nóng)業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)和信息資源總清單

http://www.agnic.org/agdb/

設(shè)在英國(guó)愛丁堡的Roslin研究所的生物信息組，發(fā)展了名為“方舟”的系統(tǒng)來(lái)搜集和比較各種動(dòng)物基因圖譜

http://www.ri.rrsrc.ac.uk/cgi-bi... swer.sh?species=pig

INRA法國(guó)國(guó)家農(nóng)業(yè)研究所

http://locus.joun.inra.fr/

美國(guó)得克薩斯AM大學(xué)是牛類基因圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)的原始網(wǎng)址和綿羊、馬數(shù)據(jù)庫(kù)的鏡象點(diǎn)：

http://bos.cvm.tamu.edu/

美國(guó)衣阿華州立大學(xué)有豬和雞基因圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)的鏡象點(diǎn)：

http://www.genome.iastats.edu/

1.農(nóng)作物

UK CropNet英國(guó)農(nóng)作物植物生物信息網(wǎng)絡(luò)

http://synteny.nott.ac.uk/

INE水稻基因數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.staff.or.jp/giot/INE.html

我國(guó)水稻基因組計(jì)劃針對(duì)水稻的秈稻亞種

http://www.ncgr.ac.cn/

美國(guó)TIGR研究所維護(hù)著幾個(gè)與水稻基因組有關(guān)的數(shù)據(jù)庫(kù)，包括基因組注釋庫(kù)、重復(fù)序列庫(kù)，以及基因索引

http://www.tigr.org/tdb/rice/

RiceGenes是美國(guó)康奈爾大學(xué)的水稻基因組數(shù)據(jù)庫(kù)

http://ars-genome.cornell.edu/ricd/

GrainGenes是美國(guó)農(nóng)業(yè)部和國(guó)家農(nóng)業(yè)圖書館的植物基因組計(jì)劃支持的麥、燕麥和甘蔗遺傳數(shù)據(jù)庫(kù)

http://ars-genome.cornell.edu/rice/

關(guān)于世界范圍的水稻生產(chǎn)和市場(chǎng)等情況

http://www.riceweb.org/

WHEAT小麥基因圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)

http://wheat.pw.usda.gov/

KOMUGI日本小麥網(wǎng)，是由不得６所大學(xué)和研究所聯(lián)合維護(hù)

http://www.shigen.nig.ac.jp/wheat/top.html

MaizeDB玉米基因組數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.agron.misouri.edu/top.html

ZmDB玉米基因組數(shù)據(jù)庫(kù)

http://zmdb.iasstate.edu/

ILDIS國(guó)際豆科植物數(shù)據(jù)庫(kù)和信息服務(wù)

http://www.ildis.org/LegumeWeb/

豆類基因圖譜：

http://scaffold.biologie.uni-kl.de/Beanrdf/

MGI,NCGR和Samuel Roberts Noble基金會(huì)聯(lián)合開展的豆科苜蓿屬植物Medicago truncatula的基因組研究，在2000年４月已經(jīng)提交15000多條EST

http://www.ncgr.org/research/mgi/

cottonDB美國(guó)南方平原農(nóng)業(yè)研究中心所維護(hù)的棉花數(shù)據(jù)庫(kù)

http://algodon.tamu.edu/

TreeGenes樹木遺傳圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)

http://probe.nalusda.gov:8000/plant/abouttreegenes.html

2.家畜、家禽和魚類

ChickGBASE雞基因圖譜計(jì)劃，搜集全世界雞基因圖譜信息

http://www.ri.bbsrc.ac.uk/chickmap/chickgbase/manager.html

Swimemap豬基因圖譜計(jì)劃，飲食店染色體圖譜和標(biāo)記

http://sol.marc.usda.gov/genome/swine/swine.html

PiGBASE,豬基因圖譜信息庫(kù)

http://www.ri.bbsrc.ac.uk/pigmap/arkpig/

SheepBase已發(fā)表的綿羊基因位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(kù)

http://dirk.invermay.cri.nz/

Goatmap,山羊基因圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)

http://locus.jouy.inra.fr/

HorseMap馬基因圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)

http://locus.jouy.inra.fr/

Bovmap法國(guó)的牛基因圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)

http://locus.jouy.inra.fr/cgi-bin/bovmap/intro.pl

BovBase英國(guó)的?；驁D譜數(shù)據(jù)庫(kù)

http://www.ri.bbsrc.ac.uk/bovmap/arkbov/

BovGBASE美國(guó)農(nóng)業(yè)部的家畜基因組圖譜計(jì)劃中的?；驍?shù)據(jù)庫(kù)

http://probe.nalusda.gov:8000/animal/aboutbovgbase.html

Buffmap水牛基因圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)。

http://locus.jouy.inra.fr/

DogMap狗基因圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)。

http://ubeclu.unibe.ch/itz/dogmap.html

CatMap貓基因圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)。

http://www.ri.bbsrc.ac.uk/catmap/ark/

RabbitMap兔基因圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)。

http://locus.jouy.inra.fr/

RainMap彩虹鱒魚基因圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)。

http://locus.jouy.inra.fr/

另一個(gè)鱒魚科基因數(shù)據(jù)庫(kù)在美國(guó)華盛頓州立大學(xué)：

http://www.wsu.edu:8000/~thorglab/DATA.html

十五．生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)

MEDLINE是美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書館的文獻(xiàn)摘要庫(kù)，反映美國(guó)及其他國(guó)家3800多種醫(yī)學(xué)和生物期刊的作者摘要和引用情況。

http://www.nlm.nih.gov/dtabases/medline.html

最為方便的查詢MEDLINE的方式，是通過(guò)NCBI的PubMed服務(wù)：

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/

SeqAnalRef這是由A.Bairoch個(gè)人維護(hù)的有關(guān)序列分析的文獻(xiàn)目錄。

http://www.espasy.ch/seqanalref/

SCI是設(shè)在美國(guó)費(fèi)城的科學(xué)信息研究所所提供的文獻(xiàn)引用情況的檢索服務(wù)。

http://webofscience.com/

CancerWeb癌癥網(wǎng)頁(yè)：

http://www.graylab.ac.uk/cancerweb.html

HUMAT人體解剖學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)。

http://ed.ac.uk/anatomy/database/humat/

KeyNet按生物序列功能組織的基因和蛋白質(zhì)名稱關(guān)鍵字庫(kù)。

http://www.ba.cnr.it/keynet.html/

BioABACUS生物學(xué)與生物技術(shù)以及計(jì)算機(jī)科學(xué)縮寫字表。

http://www.nmsu.edu/~molbio/bioABACUShome.html

十六．其他數(shù)據(jù)庫(kù)

Taxonomy分類學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)。

http://www3.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/tax.html

ETI世界生物多樣性數(shù)據(jù)庫(kù)設(shè)在荷蘭的分類鑒定專家中心。

http://www.eti.uva.nl/

位于美國(guó)麻省的Woods Hole海洋生物研究室有一個(gè)海洋動(dòng)物數(shù)據(jù)庫(kù)。

http://www.mbl.edu/

TAED適應(yīng)性演化數(shù)據(jù)庫(kù)。

http://www.sbc.su.se/~liberles/TAED.html